В 1985 году окончил 2-й Московский ордена Ленина государственный медицинский институт им. Н. И. Пирогова по специальности «Педиатрия».
В 1996 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Реконструктивная хирургия переднего отрезка глаза с короткой передне-задней осью у больных с начальной закрытоугольной глаукомой».
С 1997 года Кирилл Борисович Першин — медицинский директор офтальмологических клиник «Эксимер».
В 2000 году защитил докторскую диссертацию на тему «Клинико-физиологическое и офтальмо-эргономическое обоснование критериев восстановления функционального состояния зрительного анализатора».
Першин Кирилл Борисович — врач высшей категории, владеет всеми методами современной офтальмодиагностики, офтальмохирург широкого профиля. Им выполнено более 100 000 офтальмологических операций, из них более 8000 за рубежом, включая такие как факоэмульсификация с имплантацией интраокулярной линзы, операция по поводу глаукомы, отслойки сетчатки, витреоретинальные вмешательства, все рефракционные и эксимер-лазерные операции, кератопластика, операции на придатках глаза.
В 2003 году Российская Академия Естественных Наук наградила Кирилла Борисовича Першина Почетной Медалью Академии «За практический вклад в укрепление здоровья нации», а в 2004 году Президиум Российской Академии Естественных Наук вручил ему орден и присвоил Почетное звание «Рыцарь науки и искусств».
На сегодняшний день является одним из самых активно оперирующих хирургов в стране и мире (ежегодно проводит более 5000 факоэмульсификаций и более 1000 эксимер-лазерных коррекций в год). На международном съезде офтальмологов по рефракционной и катарактальной хирургии, проходившем в 2002 году в Москве, ему был присвоено звание Лучшего Офтальмохирурга Года.